临床研究已经表明，心房颤动（AF）会令生活质量下降、死亡率增加。相对于无AF者，有AF者的卒中1年死亡率、卒中致残率均较高，而控制AF心室率并不能够改善预后。因此，在控制AF心室率的同时必须要重视血栓形成。
一、AF的抗凝治疗与抗血小板治疗
AF的抗凝治疗可以使年栓塞率减少60%～70%。但是，INR的有效窗口并不确定，这一方面与有效治疗的窗口窄有关，另一方面与药物的相互作用有关。这在很大程度上限制了华法林的临床应用。在我国，华法林的应用率远远低于美国、加拿大和英国。日本近期的华法林相关研究表明，低剂量华法林（INR维持于1.6～2.6）抗凝治疗，严重出血和颅内出血发生率分别为每人年2.38%和每人年0.60%，显著高于西方人，INR≥2.27是严重出血的独立危险因素之一。这提示，亚裔应用华法林发生颅内出血的风险可能较高。
2006年发表的中国AF患者的抗栓治疗研究结果表明，死亡和缺血性卒中的发生率在阿司匹林组高于华法林组，而出血的发生率华法林组显著高于阿司匹林组。
ACTIVE-W 试验为对比AF患者氯吡格雷+阿司匹林（3335例）与华法林（3371例）两种抗栓策略。试验因主要终点事件华法林明显优于强化抗血小板组提前终止，这提示尽管华法林存在诸多的不足，该研究仍肯定了可靠疗效。而ACTIVE-A试验则比较了氯吡格雷＋阿司匹林与安慰剂＋阿司匹林的疗效与副作用。结果表明，氯吡格雷＋阿司匹林组主要血管事件减少明显，其中以卒中为著，而大出血率增加。
二、AF抗栓的非药物治疗
1、外科手术
左心耳堵闭术与微创外科切除左心耳均是有效的预防AF患者形成血栓的方法。
2、导管消融是房颤的有效方法
恢复窦律可以显著降低卒中率。因此，AF导管消融恢复窦律能够改善预后。