编者按：近年来，肿瘤诊疗水平突飞猛进，癌症幸存者数量呈上升趋势，患者生存期内的心血管健康问题也得到专家学者的关注。近日，在XICC 2019的肿瘤心脏病学论坛上，北京大学基础医学院崔庆华教授基于其开展的研究，介绍了心血管miRNA指纹作为肿瘤标志物的相关内容。
北京大学基础医学院 崔庆华教授
ENCODE展望
1. 确定基因功能
目前，尽管拥有庞大的数据资料库，但研究人员尚未完全掌握人体中不同类型细胞中的所有基因元件的功能。因此，国家人类基因组研究所打算与ENCODE计划相关的研究项目，该项目预计至少持续4年。在下一个研究计划中，DNA元件百科全书将对功能元件的种类和细胞种类进行深度细化研究，同时，也需为更加复杂的数据分析研发新的工具。
2.为生理学和医学提供数据
与疾病相关的遗传变异基因并不在蛋白质编码基因的区域内，既往所谓的垃圾DNA在控制细胞、器官和其他组织的行为上起关键作用，它们对人类的健康和疾病有非常重要的影响。这些非编码DNA区域的基因突变与疾病的具体联系尚待进一步的研究和探讨，但毫无疑问，这项计划中关于基因调控的深入研究将会促进未来医学科学的发展。
miRNA集合分析的历史
2008年，PLoS ONE发表的一篇文章提出并证明了miRNA集合概念。2010年，出现miRNA集合分析算法和软件TAM，其中，TAM预测9个新的心肌梗死相关miRNA，有8个（89%）后期获得验证，分别为miR-24、miR-133a、miR-221、miR-222、miR-23a、miR-133b、miR-206和miR-208b。TAM是miRNA集合分析最广泛使用的工具，TAM分析发现，癌症患者血液中致癌miRNA减弱，抑癌miRNA增强，且在免疫反应富集。由此提出假说：“癌症患者血液miRNA可能具有抗癌功能”。
研究者还运用TAM算法预测吸烟对青年人和中年人的影响。青年人吸烟激活的miRNA富集的前15种疾病中，12种（80%）为血液系统肿瘤。中年人吸烟激活的miRNA富集的前15种疾病中，血液系统肿瘤只有4种，而肝、胃、肠和胰腺等消化系统肿瘤最富集，肺癌排第二。
另外，比利时鲁汶大学Patrice D.Cani教授采用MicroPattern分析二甲双胍引起健康动物肠道菌群变化。结果表明，二甲双胍或可用于糖尿病前期的患者，甚至也能对非糖尿病患者带来获益。
2019年，单样本（single-sample）miRNA集合分析工具ssTAM的出现，将miRNA set作为复杂疾病生物标志物。单样本的血管稳态、心肌重构ssTAM分级，对癌症诊疗具有预测能力。