介绍:抗心律失常药和许多其他药物的一个严重副作用是药物诱发的长QT综合征(diLQTS)与尖端扭转型室速。为了研究常见的遗传变异对diLQTS风险的影响需要大量的病例和对照人群。
方法:来自Leducq网络得7个中心协作收集diLQTS病例和对照人群进行全基因组相关研究(GWAS)。对照人群是暴露于致QT间期延长的抗心律失常药,△QTc<50且无QTc>500。来自这项合作研究的样本使用日本RIKEN中心的Illumina Infinium 610Quad BeadChip进行基因分型。
结果:9个DNA样本的质量欠佳,在之后的分析中排除。在进行基因分型的592,532个SNP中,28,137个SNP因基因分型效率或成功率低被排除(≤90%),3484个SNP因在数据集中呈单型性被排除,38,242个SNP因等位基因频率≤1%被排除。计算每个SNP的遗传平衡(HWE),偏离HWE的SNP被注明但不从分析中排除。对于最后的554,6261个SNP位点,单SNP检测相关性采用了另一个遗传模型,使用PLINK在欧洲183例患者和519个对照者中进行。相关性试验也校正了年龄和性别。我们在第9号染色体上确定了一个与diLQTS相关的SNP,p<7.0x10-8(比值比=2.28;95%置信区间:1.69-3.08)。我们在第9、11和19号染色体上还确定了另外4个相关,P<9.0x10-7,以及在第7、9、13、19和21号染色体上的另外10个相关p<9.0x10-6。在与diLQTS最显著相关的15个SNP中,只有3个在基因区域,没有一个在已知的miRNA附近,且没有一个在diLQTS候选基因或区域内。
结论:我们已经确定了可能与diLQTS相关的新的基因组区域。需要进一步的研究重复这些结果,并确定这些新的候选区域的功能,从而更好地确定个体基因变异对diLQTS发生的影响。
编译:陈颖 北京大学人民医院