单核苷酸多态性(single nucleotide polymorphisms,SNPs)指基因组染色体DNA序列的某个位点上单个核苷酸的变异性,是继限制性片断长度多态性(restriction fragment length polymorphism,RFLP)及可变数串联重复序列即 (various number of tandem repeats,VNTR)之后的第三代多态性遗传标记。如果一个群体中存在两种以上等位基因并且最低基因频率≥1%,即认为具有SNPs,这种变异性往往由单个碱基的转换(transition)或颠换(transversion)所引起。人类基因组计划的完成,以功能基因组学和蛋白质组学为标志的后基因组时代的到来,使遗传性心律失常的基因多态性研究取得了长足的进步。
1.与心律失常相关的基因多态性
2000年日本Iwasa等公布了19个直接与获得性长QT综合征有关的心脏离子通道基因SNPs,其中7个位于KCNQ1,6个位于HERG,4个位于SCN5A,2个位于KCNE1。2003年的AHA大会Ackerman搏士报导了22个SCN5A基因的SNPs,之后又发表了49个SCN5A基因SNPs在白人、黑人、亚洲人和美洲西版牙语人的差异性分布,共发现KCNQ1(16个)、KCNE1(5个)、KCNH2(25个)、KCNE2(3个),其中K897T-HERG和G38S-minK为四种系人群共存。相当一部分SNPs的频率分布在不同种族、不同人群中有显著差异。2006年Bezzina等发现位于编码SCN5A基因启动子区的HaplotypeB单倍体型变异,其等位基因频率在亚裔人群中为22%,而在白种人和黑种人中缺如,这与Brugada综合征在东南亚人群中高发具有一致性。
此外,至今还报导了与心律失常有关的非离子通道基因的SNPs。Groenewegen等发现Connexin40基因多态性-44G→A和+71A→G,位于调控区和转录起始部,占人群的7%,纯合子型与心房静止和心房颤动有关。ACE基因SNPs与心源性猝死(SCD)有关。ACE基因第16个内含子287个bp插入(I)或缺失(D)组成了II,ID和DD三种等位基因组合。ACE-DD型的肥厚性心肌病患者高发SCD,ACE-DD型的心肌梗死者QT离散度增加,SCD发生率亦升高。此外,血管紧张素Ⅱ1型受体(AT1)基因多态性AT1-A1166C冠心病患者高发室性心律失常。
2.心律失常基因多态性的意义
1)、SNPs改变药物的选择性 药物代谢和作用在不同群体和同一群体不同个体间的差别20%-95%由基因引起,如个体间药物作用酶、药物转运体系、药物作用点基因的多态性引起。SNPs本身只轻度或不改变通道蛋白的功能,且杂合子等位基因不足以致病,但由于SNPs的存在,改变了心脏以外药物对心脏离子通道的选择性。如磺胺类抗菌药sulfamethoxazole(SMZ)在少数个体中引起LQT与KCNE2基因(编码IKr通道的?亚基)SNPs(T8A)有关,KCNE2 T8A本身并不改变IKr电流,但可提高药物对Ikr的敏感性。SMZ加速Ikr灭活,KCNE2 T8A个体服药后易引起QT间期延长,导致尖端扭转性室速(TdP)。
2)、SNPs影响突变基因的致病性 Makielski和Ackerman的协作研究表明SNPs改变了突变基因的致病性。他们发现的婴儿猝死综合症相关突变SCN5A M1766L明显抑制了INa而致病,当其与H558R(频率10%)共同表达时,M1766L/H558R通道电流与野生SCN5A接近,表明H558R消除了M1766L的致病性。Balser实验室体外研究发现H558R部份消除了T512I突变的功能异常,纠正了T512I引起的激活、失活曲线负向漂移,但不能完全纠正其缓慢失活的动力学,T512I/H558R仍表现为房-室传导阻滞。因此,SNPs在心律失常的发生机制中也可能起着重要的作用。
由此可见,单核苷酸基因多态性在心律失常的发生发展、药物作用疗效和副作用的产生等诸方面起着相当重要的作用,对此进行深入研究是后基因组时代心律失常相关基因功能研究的重大任务之一,对于进一步阐明心律失常的基因机制具有重要意义。